Лаборатория кристаллографии макромолекул
Публикации
По состоянию на 01 января 2003
Внимание! Полные тексты статей, препринтов, диссертаций могут быть найдены здесь.
Статьи в журналах
- Lunin, V.Y., Afonine, P.V. & Urzhumtsev, A.G. (2002). "Likelihood-based refinement. I. Irremovable model errors".
Acta Cryst. A58, 270–282.
- Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A. & Bockmayr, A. (2002). "Direct phasing by binary integer programming".
Acta Cryst. A58, 283–291.
- Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Ritter, S., Frey, I., Berg, A., Diderichs, K., Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.
& Baumstark M.W. (2001). "Low-resolution data analysis for low-density lipoprotein particle".
Acta Cryst., D57, 108-121.
- Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (2001). "Fast differentiation algorithm and efficient calculation of the
exact matrix of second derivatives". Acta Cryst. A57, 451-460.
- Lunin , V.Y. (2000). "Fixed-scale wavelet-type approximation of periodic density distributions".
Acta Cryst. A56, 73-84.
- Lunin, V.Y., Lunina, N.L. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Connectivity properties of high-density regions
and ab initio phasing at low resolution". Acta Cryst. A56, 375-382.
- Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Skovoroda, T.P., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (2000).
"Low-resolution ab initio phasing: problems and advances". Acta Cryst. D56, 1223-1232.
- Urzhumtsev, A.G., Lunina, N.L., Skovoroda, T.P., Podjarny, A.D. & Lunin, V.Y. (2000). "Density
constraints and low-resolution phasing". Acta Cryst. D56, 1233-1244.
- Petrova, T.E., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (2000). "Ab initio low-resolution phasing in crystallography
of macromolecules by maximization of likelihood". Acta Cryst. D56, 1245-1252.
- Shlyapnikov, S.V., Lunin, V.V., Perbandt, M., Polyakov, K.M., Lunin, V.Yu., Levdikov, V.M., Betzel,
Ch.& Mikhailov, A.M.. (2000). "Atomic structure of the Serratia marcescens endonuclease at 1.1 A
resolution and the enzyme reaction mechanism." Acta Cryst. D56, 567-572.
- Сковорода Т.П., Лунин В.Ю. (2000). "Надежность показателей достоверности, вычисляемых на базе принципа
максимума правдоподобия". Кристаллография, 45, №2, 227-230.
- Lunin, V.Y., Lunina, N.L. & Urzhumtsev, A.G. (1999). "Seminvariant density decomposition and
connectivity analysis and their application to very low resolution macromolecular phasing". Acta Cryst.
A55, 916-925.
- Petrova, T.E., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (1999). "A likelihood-based search for the macromolecular
position in the crystalline unit cell". Acta Cryst. A55, 739-745.
- Лунин В.Ю., Благова Е.В., Левдиков В.М., Лунин В.В., Шляпников С.В., Пербандт М., Райшанкар К.С.,
Бетзель Х., Михайлов А.М. (1999). "Внеклеточная эндонуклеаза. I. Пространственная структура белка в
кристаллическом состоянии при разрешении 1.7А". Молекулярная биология, 33, 2, 214-222.
- Шляпников С.В., Благова Е.В., Левдиков В.М., Лунин В.Ю., Лунин В.В., Михайлов А.М., Бетзель Х.,
Райшанкар К.С., Пербандт М., (1999). "Внеклеточная эндонуклеаза. II. Аминокислотные остатки активного центра
и гипотетический механизм функционирования фермента". Молекулярная биология, 33, 454-461.
- Петрова Т.Е., Лунин В.Ю., Лунина Н.Л., Сковорода Т.П. (1999). "Выбор априорного распределения координат
атомов для макромолекулярных структур на основании принципа максимума правдоподобия". Биофизика,
44, 1, 22-26.
- Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1999). "Tcl/Tk based programs. III. CRITXPL: graphical analysis
of the X-PLOR refinement log-files". J.Appl. Cryst.,32, 376-377.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1998). "On the Ab initio
solution of the Phase Problem for Macromolecules at Very Low Resolution. II. Generalized Likelihood Based
Approach to Cluster Discrimination". Acta Cryst. D54, 726-734.
- Lunin, V.Yu., Levdikov, V.M., Shliapnikov, S.V., Blagova, E.V., Lunin, V.V., Wilson, K.S. & Mikhailov,
A.M. (1997). "Three-dimensional structure of Serratia marcescens nuclease at 1.7 Ǻ resolution
and mechanism of its action". FEBS Letters, 412, 217-222.
- Urzhumtsev, A., Tête-Favier, F., Mitschler, A., Barbanton, J., Barth, P., Urzhumtseva, L., Biellmann,
J-F., Podjarny, A.D. & Moras, D. (1997). "A 'specificity' pocket inferred from the crystal structures
of the complexes of aldose reductase with the pharmaceutically important inhibitors tolrestat and
sorbinil". Structure, 5, 5, 601-612.
- Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1997). "Tcl/Tk-based programs. II. CONVROT: a program to
recalculate different rotation descriptions". J.Appl.Cryst., 30, 402-410.
- Urzhumtsev, A.G. (1997). "Local improvement of electron density maps". Acta Cryst., D53,
540-543.
- Podjarny, A.D., Howard, E.I., Urzhumtsev, A.G. & Grigera, J.R. (1997). "A Multicopy Modeling of the
Water Distribution in Macromolecular Crystals". Proteins, 28, 303-312.
- Lunin, V.Yu. & Lunina, N.L. (1996). "The Map Correlation Coefficient for Optimally Superposed Maps".
Acta Cryst. A52, 365-368.
- Urzhumtsev, A.G., Skovoroda, T.P. & Lunin, V.Yu. (1996). "A procedure compatible with X-PLOR for the
calculation of electron-density maps weighted using an R-free-likelihood-based approach".
J.Appl.Cryst., 29, 741-744.
- Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A. & Podjarny, A.D. (1996). "Approaches to Very Low Resolution Phasing
of the Ribosome 50S particle from Thermus thermophilus by the Few-Atoms-Models and Molecular-Replacement
Methods". Acta Cryst., D52,1092-1097.
- Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1995). "R-free Likelihood-Based Estimates of Errors for Phases
Calculated from Atomic Models". Acta Cryst. A51, 880-887.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995).
"On the ab-initio Solution of the Phase Problem for Macromolecules at Very Low Resolution: the Few Atoms
Model Method". Acta Cryst., D51, 896-903.
- Navaza, J.& Vernoslova, E. (1995). "On the Fast Translation Functions for Molecular Replacement".
Acta Cryst. A51, 445-449.
- Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "On the Solution of the Molecular Replacement Problem at Very
Low Resolution: Application to Large Complexes". Acta Cryst., D51, 888-895.
- Tete-Favier, F., Barth, P., Mitchler, A., Podjarny, A.D., Rondeau, J.-M., Urzhumtsev, A., Biellmann, J.-F.
& Moras, D. (1995). "Aldose Reductase from Pig Lens". European Journal of Medicinal Chemistry,
30, S, 589-603.
- Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1994). "Programs for translation searches with two independent models
simultaneously". J.Appl.Cryst., 27, 122-124.
- Lunin, V.Yu. (1993). "Electron-Density Histograms and the Phase Problem". Acta Cryst. D49,
90-99.
- Vernoslova, E.A. & Lunin, V.Yu. (1993). "The FROG PC series: programs for electron-density and model
investigation for proteins", J.Appl.Cryst., 26, 291-294.
- Lunin, V.Yu. & Woolfson, M.M. (1993). "Mean Phase Error and the Map Correlation Coefficient".
Acta Cryst. D49, 530-533.
- Моргунова Е.Ю., Михайлов А.М., Уржумцев А.Г., Вайнштейн Б.К. (1992). "Строение капсида CMtV при разрешении
6А в кристаллическом состоянии". Кристаллография, 37, 2, 396-404.
- Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1991). "Frequency-Restrained Structure Factor Refinement. I. Histogram
Simulation". Acta Cryst. A47, 45-52.
- Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1991). "Frequency-Restrained Structure Factor Refinement. II.
Comparison of Methods". Acta Cryst. A47, 238-243.
- Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A., Vernoslova, E.A., Nikonov, S.V., Sergeev, Yu.V., Brazhnikov, E.V.,
Fomenkova, N.P., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1991). "Crystal structure of calf eye lens
gamma-crystallin IIIb at 2.5A resolution: its relation to function". Experimental Eye Research,
53, 295-304.
- Чиргадзе Ю.Н., Бражников Е.В., Никонов С.В., Фоменкова Н.П., Гарбер М.Б., Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю.,
Чиргадзе Ю.Н., Некрасов Ю.В. (1991). "Кристаллическая структура рибосомного фактора G из бактерий
Thermus Thermophilus при низком разрешении". Доклады АН СССР320, в.2, 488-491.
- Urzhumtsev, A.G. (1991). "How to calculate planarity restraints". Acta Cryst. A47, 723-727.
- Urzhumtsev, A.G. (1991). "Low-resolution phases: influence on SIR-syntheses and retrieval with
double-step filtration". Acta Cryst. A47, 794-801.
- Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Skovoroda, T.A. (1990). "Direct low-resolution phasing from
electron-density histograms in protein crystallography". Acta Cryst., A46, 540-544.
- Лобсанов Ю.Д., Плетнев В.З., Втюрин Н.Н., Лубнин М.Ю., Мокульский М.А., Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю.,
Лузянина Т.Б. (1990). "Рентгеноструктурные исследования комплекса лектина из гороха с углеводом при
разрешении 2,4А. I. Биоорганическая химия, 16, 12б 1589-1598.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Luzyanina, T.B. (1989). "Bounding a Molecule in a Noisy Synthesis".
Acta Cryst., A45, 34-39.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1989). "FROG - high-speed restraint-constraint
refinement program for macromolecular structure". J.Appl.Cryst., 22, 500-506.
- Lunin, V.Yu. (1989). "The Calculation of the Second Moments for the Values of Fourier Syntheses with Random
Structure Factors". Acta Cryst. A45, 501-505.
- Lunin, V.Yu. (1988). "Use of Information on Electron Density Distribution in Macromolecules".
Acta Cryst A44, 144-150.
- Лунин В.Ю. (1988). "Восстановление недостающих структурных факторов при рентгеноструктурном исследовании
макромолекул". Доклады АН СССР, 299, в.2, 363-366.
- Чиргадзе Ю.Н., Невская Н.А., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Сергеев Ю.В., Бражников Е.В., Гарбер М.Б.,
Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Вернослова Е.А. (1986). "Пространственная структура гамма-кристаллина
IIIb из хрусталика глаза теленка при разрешении 2,5Ǻ". Доклады АН СССР, 290, 2, 492-495.
- Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A. & Fomenkova,
N.P. (1985). "Phase Improvement in Protein Crystallography Using a Mixed Electron Density Model".
Acta Cryst., A41, 166-171.
- Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1985). "Program construction for macromolecule atomic model refinement
based on the fast Fourier transform and fast differentiation algorithms". Acta Cryst.,
A41, 327-333.
- Lunin, V.Yu. (1985). "Use of the Fast Differentiation Algorithm for Phase Refinement in Protein
Crystallography". Acta Cryst. A41, 551-556.
- Вазина А.А., Корыстова А.Ф., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Лунин В.Ю., Козлов М.А., Крайзман В.Л.
(1985). "Исследование структуры металлсвязывающих центров кальмодулина методом EXAFS-спектроскопии".
Молекулярная биология, 19, в.6, 1643-1647.
- Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1984). "Improvement of Protein Phases by Coarse Model Modification".
Acta Cryst., A40, 269-277.
- Вазина А.А., Корыстова А.Ф., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Лунин В.Ю., Козлов М.А., Крайзман В.Л. (1984).
"Исследование Ca2+ -связывающих центров парвальбумина по дальней тонкой структуре рентгеновских спектров поглощения". Молекулярная биология, 18, в. 3, 681-684.
- Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1983). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем
уточнения модельной структуры. I. Численные эксперименты". Кристаллография, 28, в.2, 310-315.
- Чиргадзе Ю.Н., Сергеев Ю.В., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Лунин В.Ю. (1980). "Определение структуры
g-кристаллина II из глазной линзы теленка с разрешением 5Ǻ". Доклады АН СССР, 250,
в.3, 762-765.
- Chirgadze, Yu.N., Oreshin, V.D., Sergeev, Yu.V., Nikonov, S.V. & Lunin, V.Yu. (1980). "Structure
of gamma-crystallin IIIb from calf lens at 5A resolution". FEBS Letters, 118, 2, 296-298.
Статьи в сборниках
- Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A. & Bockmayr, A. (2002). "Direct phasing by Binary integer programming and
its use for envelope determination". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 40 12.
- Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2002). "Search of the optimal strategy for refinement of
atomic models". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 40 14.
- Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Podjarny A.D. (2002) "Retrieval of lost reflections in high resolution
Fourier syntheses by a ‘soft’ solvent flattening". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography,
41 10.
- Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Maximum-likelihood refinement of atomic models
using least-squares criterion". CCP4 Newsletter on protein crystallography, 39, 52-56.
- Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (2001). "Efficient calculation of the exact matrix of the second
derivatives". CCP4 Newsletter on protein crystallography, 39, 60-67.
- Lunin, V.Y., Podjarny, A.D. & Urzhumtsev, A. (2001). "Low-resolution phasing in macromolecular
crystallography". In : Advances in Structure Analysis, CSCA, Prague, Czech Republic, R.Kuzel &
J.Hasek, eds., 4-36.
- Urzhumtsev, A., Podjarny, A. & Lunin, V.Y. (2001). "Ab initio phasing starting from low resolution".
Invited article. Euroconference on Phasing, 23-27 June 2001, Martina Franca, Italy, 4.35-4.40.
- Lunin V.Y. & Urzhumtsev A.G. (1999). “Maximal Likelihood Refinement. It works, but why?", CCP4
Newsletter on Protein Crystallography, 37, 14-28.
- Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1998). "Programs Tcl/Tk based crystallographic software:
current state and new programs". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 35, 22-24.
- Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. & Lunin, V.Y. (1998). "On density modification at very low
resolution". CCP4 Newsletter on Protein Crystallography, 35, 25-33.
- Lunin, V.Y. (1997). "The likelihood based choice of priors in statistical approaches to the phase problem".
In Direct Methods for Solving Macromolecular Structures, ed. S.Fortier, NATO ASI Series C,
Vol.507, 451-454.
- Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (1997). "Model based low resolution phasing". In
Direct Methods for Solving Macromolecular Structures, ed. S.Fortier, NATO ASI Series C, Vol.507,
421-431.
- Urzhumtsev A.G., Lunin V.Yu. & Podjarny A.D. (1997). "Low resolution crystallographic images".
In "Recent Advances in Phasing", ed. By K.S.W.Wilson, G.Davies, A.W.Ashton & S.Bailey,
Proceedings of the CCP4 Study Weekend, University of York, 3-4 January, 1997, 207-214.
- Podjarny, A.D. & Urzhumtsev, A.G. (1997). "Low resolution phasing". In Methods in Enzymology,
Academic Press, San Diego., C.W.Carter, Jr., R.M.Sweet, eds. 276A, 641-658.
- Urzhumtsev, A.G. (1996). "Density growing: a method for local improvement of electron density maps".
Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 32b, 36-39.
- Urzhumtsev, A.G. (1996). "Relations between some rotation descriptions for molecular replacement procedure".
Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 32b, 43-46.
- Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1996). "Tcl/Tk-based programs. I. CONFOR - user-friendly converter
for crystallographic data files". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography,
32b, 40-42.
- Podjarny, A.D., Rees, B. & Urzhumtsev, A.G. (1996). "Density modification in X-ray crystallography".
In Methods in Molecular Biology, 56: "Crystallographic Methods and Protocols
", ed.
C.Jones, B.Milloy, M.R.Sanderson, Totowa, New Jersey: Humana Press, 205-226.
- Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "On the problem of solvent modeling in macromolecular
crystals using diffraction data: 1.The low-resolution range". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on
Protein Crystallography, 31, 12-16.
- Volkmann, N., Schlünzen, F., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Podjarny, A.D., Roth, M.,
Pebay-Peyroula , E., Berkovitch-Yellin, Z., Zaytzev-Bashan, A. & Yonath, A. (1995). "On ab-initio
phasing of ribosomal particles at very low resolution". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein
Crystallography, 31, 23-32.
- Ivanov, M.E. & Urzhumtsev, A.G. (1995). "FROG PC - a menu-based environment for atomic model refinement
program on a personal computer". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography,
31, 20-22.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1994).
"On the ab-initio solution of the phase problem for macromolecules at very low resolution. The Few Atoms
Model method". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 37-44.
- Vernoslova, E.A. & Urzhumtsev, A.G. (1994). "Current development in the program package FROG for atomic
model refinement". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 27-28.
- Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. & Navaza, J. (1994). "On the solution of the molecular replacement
problem at very low resolution". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography,
30, 29-36.
- Urzhumtseva, L.M. & Urzhumtsev, A.G. (1994). "Published methods in crystallography. Reference database
on personal computers". Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 30, 45-47.
- Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Navaza, J. (1994). "On the solution of the molecular replacement
problem at very low resolution: application to a ribosome model crystal". ACA Transactions,
30, 109-120.
- Urzhumtsev, A.G. (1992). "On the reliability of atomic models in the PDB: stereochemical point of view".
Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 31-32.
- Vernoslova, E. & Lunin, V. (1992). "FAN Scalar Field Analysis", Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter
on Protein Crystallography, 27, 35.
- Vernoslova, E. (1992). "FFT Discrete Three-Dimensional Fourier transform". Joint CCP4 and ESF-EACBM
Newsletter on Protein Crystallography, 27, 36.
- Vernoslova, E. & Lunin, V. (1992). "CAN Comparative Analysis of three-dimensional Functions".
Joint CCP4 and ESF-EACBM Newsletter on Protein Crystallography, 27, 37.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1990). "New refinement program FROG gives new
possibilities to study macromolecular models". Proc.of the First Intern. Meeting on Structure and
Chemistry of Ribonucleases, Moscow, USSR, December 1989, 410-415.
- Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Вернослова Е.А. (1989). "FROG - комплекс программ для локального уточнения
атомной структуры макромолекул". В сб. "Компьютерные методы белковой инженерии", Программное
обеспечение ЭВМ, Институт математики АН БССР, Институт биоорганической химии, 86, 86-97, Минск.
- Вазина А.А., Корыстова А.Ф., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Козлов М.А., Крайзман В.Л., Лунин В.Ю.
(1984). "Исследование металл-связывающих центров в тропонине, кальмодулине и парвальбумине с
использованием EXAFS -спектров". Труды IV Всесоюзной конференции по использованию синхротронных
источников, Новосибирск 1984, 250-254.
Препринты, программные выпуски
- Лунин В.Ю. (1994). "Математический аппарат рентгеноструктурного анализа макромолекул". Цикл лекций
для магистрантов кафедры прикладной математики Пущинского Государственного Университета. Рукопись.
- Lunin, V.Yu. style='mso-spacerun:yes'> (1991). "Use of the electron-density-syntheses histograms or
solving of the phase problem in protein crystallography". Preprint, Pushchino Research Center,
Pushchino, Russia.
- Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Вернослова Е.А. (1988). "Комплекс программ FROG". Материалы по
математическому обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 10, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунин В.Ю. (1986). "Использование информации о распределении значений электронной плотности в белках.
I. Восстановление недостающих структурных факторов". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Уржумцев А.Г. (1985). "Использование локального усреднения при анализе изображения макромолекул на картах
распределения электронной плотности". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Вернослова Е.А., Чиргадзе Ю.Н., Фоменкова Н.П., Невская Н.А. (1984).
"Использование смешанной модели электронной плотности для улучшения набора фаз в белковой
кристаллографии". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунин В.Ю. (1984). "Использование алгоритма быстрого дифференцирования в задаче уточнения значений фаз
структурных факторов". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1983). "Конструирование программ для уточнения атомной структуры макромолекул
на базе алгоритмов быстрого преобразования Фурье и быстрого дифференцирования". Препринт, НЦБИ АН СССР,
Пущино.
- Лунин В.Ю. (1983) "Рентгеноструктурный анализ белков. Проблемы расшифровки структуры". Препринт,
НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Гаджиев А.М., Матюшин А.М., Вазина А.А., Ясенев М.Я., Шувалов Б.Н., Лунин В.Ю. (1983). "Программное
обеспечение метода скоростной рентгеновской дифрaктометрии с высоким временным разрешением". Препринт,
НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунин В.Ю. (1982). "Оптимизация расчета структурных факторов в кристаллографии белка". Препринт,
НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Вернослов С.Е., Лунин В.Ю. (1982). "Некоторые алгоритмические вопросы обработки EXAFS-спектров".
Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунин В.Ю. (1982). "Использование метода максимального правдоподобия для оценки ошибок при определении фаз
в кристаллографии белка". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю. (1982). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем уточнения
модельной структуры. Улучшение набора фаз для g-кристаллина IIIb". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1981). "Повышение разрешения карт электронной плотности белков путем уточнения
модельной структуры. I. Описание метода". Препринт, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунин В.Ю. (1979). "Комплекс программ "Быстрое преобразование Фурье". Материалы по математическому
обеспечению ЭВМ, ФОРТРАН, 3, НЦБИ АН СССР, Пущино.
- Лунин В.Ю. (1979). "Фазовая программа Тен Эйка". Материалы по математическому обеспечению ЭВМ,
ФОРТРАН, 4, НЦБИ АН СССР, Пущино.
Диссертации, авторефераты
- Петрова Т.Е. (2000). "Использование принципа максимального правдоподобия при решении фазовой проблемы в
кристаллографии макромолекул". Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата
физико-математических наук. Пущино.
- Петрова Т.Е. (2000). "Использование принципа максимального правдоподобия при решении фазовой проблемы в
кристаллографии макромолекул". Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических
наук, Пущино.
- Лунина Н.Л. (1998). "Вычислительные подходы к решению фазовой проблемы кристаллографии биополимеров при
низком разрешении". Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических
наук. ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.
- Лунина Н.Л. (1998). "Вычислительные подходы к решению фазовой проблемы кристаллографии биополимеров при
низком разрешении". Диссертация на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук,
ИТЭБ РАН, Пущино.
- Вернослова Е.А. (1996). "Разработка и применение программного обеспечения для задач белковой
кристаллографии". Автореферат диссертации на соискание ученой степени к.ф.-м.н., ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.
- Вернослова Е.А. (1996). "Разработка и применение программного обеспечения для задач белковой
кристаллографии". Диссертация на соискание ученой степени к.ф.-м.н., Институт Кристаллографии РАН, Москва.
- Urzhumtsev, A. (1996). "Developpement de methodes et logiciels pour la determination de structures
macromoleculaires par radiocristallographie. Applications e differents projets". Synthese d’activite
scientifique, Strasbourg, 1996.
- Лунин В.Ю. (1992). "Использование статистических характеристик синтезов Фурье электронной плотности для
решения фазовой проблемы в кристаллографии белка". Автореферат диссертации на соискание ученой
степени д.ф.-м.н, ОНТИ ПНЦ РАН, Пущино.
- Лунин В.Ю. (1992). "Использование статистических характеристик синтезов Фурье электронной плотности для
решения фазовой проблемы в кристаллографии белка". Диссертация на соискание ученой степени д.ф.-м.н,
ИК РАН, Москва.
- Уржумцев А.Г. (1985). "Использование смешанной атомной модели для улучшения наборов фаз структурных факторов
при рентгеноструктурном исследовании макромолекул". Автореферат диссертации на соискание ученой степени
к.ф.-м.н, Институт Кристаллографии АН СССР, Москва.
- Уржумцев А.Г. (1985). "Использование смешанной атомной модели для улучшения наборов фаз структурных факторов
при рентгеноструктурном исследовании макромолекул". Диссертация на соискание ученой степени к.ф.-м.н,
Институт Кристаллографии АН СССР, Москва.
- Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейного эллиптического уравнения
с малым параметром". Автореферат диссертация на соискание ученой степени кадидата ф.-м.н., МГУ, Москва.
- Лунин В.Ю. (1976). "Об асимптотике решения первой краевой задачи для квазилинейного эллиптического уравнения
с малым параметром". Диссертация на соискание ученой степени кадидата ф.-м.н., МГУ, Москва.
Тезисы конференций
- Afonine, P., Lunin, V. & Urzhumtsev, A. (2002). "Quadratic approximation of the
maximum-likelihood criterion ". Acta Cryst., A58, S, C263 [Collected Abstracts,
XIXth IUCr Congress & General Assembly, 6-15 August 2002, Geneve, Switzerland, 263]
- Fokine, A., Lunina, N., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2002). "Bulk solvent and its role in
macromolecular phasing". Acta Cryst., A58, S, C267 [Collected Abstracts, XIXth IUCr
Congress & General Assembly, 6-15 August 2002, Geneve, Switzerland, 267]
- Lunin, V.Y. (2002). "Determination of three-dimensional structure of biological macromolecules: mathematics
and computers". V International Congress on Mathematical Modelling, September30-October 6, 2002, Dubna,
Moscow Region, Book of Abstracts, Volume II, Joint Institute of Nuclear Research, Laboratori of Information
Technologies, Council on mathematical modelling of RAS, Dubna 2002, 209.
- Lunina, N.L. (2002). "The use of connectivity properties of electron density distributions in determination
of structures of biological macromolecules". V International Congress on Mathematical Modelling,
September30-October 6, 2002, Dubna, Moscow Region, Book of Abstracts, Volume II, Joint Institute of Nuclear
Research, Laboratori of Information Technologies, Council on mathematical modelling of RAS, Dubna 2002, 210.
- Urzhumtsev, A., Lunina, N., Chabriere, E. & Lunin, V.Y. (2002). "Direct phasing in crystallography:
connectivity of electron density maps". Z. Krist., Suppl. 19, 16. [Collected Abstracts, DGK Meeting,
4-7 March 2002, Kiel, Germany].
- Urzhumtsev, A., Lunina, N.L. & Lunin, V.Y. (2002). "The connectivity-based choice in macromolecular low
resolution ab-initio phasing". Acta Cryst., A58, S, C43 [Collected Abstracts, XIXth IUCr
Congress & General Assembly, 6-15 August 2002, Geneve, Switzerland, 43]
- Urzhumtsev, A., Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Podjarny, A.
& Baumstark, M. (2002). "LDL particle: Direct structure determination ". Collected Abstracts, ACA
Meeting, 25-30 May 2002, San Antonio, USA, 33
- Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (2001). "Phasage ab initio à basse
résolution". AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de Cristallographie, Orsay, 3-6
juillet 2001, 95.
- Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Simulation du critère de vraisemblance
maximale par le critère de moindre carré". AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de
Cristallographie, Orsay, 3-6 juillet 2001, 97.
- Chabriere, E., Lunina, N., Urzhumtsev, A.G. & Lunin, V.Y. (2001). "Phasage ab initio par
critères de connectivité: de la basse résolution aux structures secondaires".
AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de Cristallographie, Orsay,3-6 juillet 2001, 99.
- Podjarny, A., Joachimiak, A., Howard, E., Petrova, T., Chevrier, B., Sanishvili, R., Mitschler, A. &
Moras, D. (2001). "Phasage MAD et SAD d'un complexe humain d'Aldose réductase-inhibiteur (AR, 36Kda)
à 0,90 A de résolution", AFC2001 Colloque de l’Association Francaise de Cristallographie,
Orsay, 3-6 juillet 2001, 100.
- Urzhumtsev, A., Podjarny, A. & Lunin, V.Y. (2001). "Ab initio phasing starting from low
resolution". Euroconference on Phasing Biological Macromolecules (Phabio). Martina Franca –
Italy, June 23-27, 2001, 4.35-4.40.
- Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2001). "Maximum-likelihood refinement of atomic models
using least-squares criterion". Euroconference on Phasing Biological Macromolecules (Phabio).
Martina Franca – Italy, June 23-27, 2001, 4.47-4.51.
- Afonine, P., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2001). "Maximum-likelihood refinement of atomic models
using least squares criterion". ECM-20 Abstracts, XXth European Cryst.Meeting, 25-31 August 2001,
Krakow, Poland, 148.
- Chabriere, E., Lunina, N., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2001). "From low resolution to secondary
structure elements". ECM-20 Abstracts, XXth European Cryst.Meeting, 25-31 August 2001, Krakow,
Poland, 70.
- Joachimiak, A., Howard, E., Petrova, T., Chevrier, B., Sanishvili, R., Mitschler, A. & Podjarny, A.
(2001). "The MAD Experiment at 0.9 A Producing Atomic Resolution Experimental Electron Density for 36 kDa
Human Aldose Reductase". ECM-20 Abstracts, XXth European Cryst.Meeting, 25-31 August 2001,
Krakow, Poland, 72.
- Lunin, V. V., Shlyapnikov, S.V., Perbandt, M., Betzel, Ch. & Mikhailov, A.M. (2000).
"Magnesium-dependent Serratia marcescens endonuclease: three-dimensional structure at 1.1 Å
resolution and molecular mechanism of enzyme action". Acta Cryst. A56, S, S280.
- Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Maximal Likelihood refinement. It works, but why?".
Acta Cryst. A56, S, S201.
- Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Use of map connectivity properties in
macromolecular ab-initio phasing". Acta Cryst. A56, S, S62
- Ritter, S., Lunina, N. L., Lunin, V. Y., Urzhumtsev, A. G., Podjarny, A.D., Frey, I., Diederichs, K.
& Baumstark, M.W. (2000). "Crystallization and structure determination of human low density
lipoprotein (LDL) at low resolution, using ab initio phases". Acta Cryst. A56, S, S299.
- Urzhumtsev, A., Lunin, V.Y. & Lunina, N. (2000). "Density constraints and direct phasing".
Acta Cryst. A56, S, S108
- Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (2000). "Use of map connectivity properties in
macromolecular ab-initio phasing". 19th European Crystallographic Meeting, Abstract
book, 25th-31st August 2000 Nancy, France, 62.
- Urzhumtsev, A., Lunin, V.Y. & Lunina, N. (2000). "Density constraints and direct phasing".
19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st
August 2000 Nancy, France, 108.
- Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A. (2000). "Maximal Likelihood refinement. It works, but why?".
19th European Crystallographic Meeting, Abstract book, 25th-31st
August 2000 Nancy, Franc, 201.
- Ritter, S., Lunina, N.L., Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D., Frey, I., Diederichs, K. &
Baumstark, M.W. (2000). "Crystallizacion and structure determination of human low density lipoprotein (LDL)
at low resolution, using ab initio phases". 19th European Crystallographic Meeting, Abstract
book, 25th-31st August 2000 Nancy, France, 299.
- Lunin, V.Y., Lunina, N.L., Podjarny, A.D., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Baumstark, M.W.
& Urzhumtsev, A.G. (2000). "Structure of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution: ab
initio phasing methods for structure determination". ECM19 Satellite Meeting "Frontiers in macromolecular
crystallography", Bishenberg, August, 31-September, 3, France, 31.
- Lunina, N., Lunin, V.Y., Podjarny, A., Ritter, S., Frey, I., Keul, J., Diederichs, K., Baumstark, M.
& Urzhumtsev, A. (2000). "Structure of human low density lipoprotein (LDL) at low resolution: structure
determination and analysis". ECM19 Satellite Meeting "Frontiers in macromolecular crystallography",
Bishenberg, August, 31-September, 3, France, 32.
- Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A. & Lunin, V.Y. (2000). "Direct phasing at low resolution: current
state and expectations". Millenium Symposium on Structural Biology, 26-29 March 2000, Heidelberg,
Germany, Collected Abstracts, 103.
- Lunin, V.Y., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1999). "Low resolution phasing. Achievements and
perspectives". XVIII Congress and General Assembly of IUCr, Glasgow, Scotland, UK, August 4-13, 1999.
Collected Abstracts, 121.
- Petrova, T.E., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (1999). "Ab-initio calculation of envelopes for
macromolecules by maximization of likelihood". XVIII Congress and General Assembly of IUCr, Glasgow,
Scotland, UK, August 4-13, 1999. Collected Abstracts, 183.
- Lunina, N.L., Lunin, V.Y. & Urzhumtsev, A.G. (1999). "The connectivity-based choice in macromolecular
low resolution ab-initio phasing". XVIII Congress and General Assembly of ICU, Glasgow, Scotland,
UK, August 4-13, 1999. Collected Abstracts, 123.
- Urzhumtsev, A.G., Lunina, N. & Lunin, V. (1999) "Proprietes Topologiques et Phasage Direct".
GTBio-99, 12-15 Oct. 1999,Hourtin (Bordeaux, France), CO31.
- Lunin, V.V., Lunin, V.Yu., Blagova, E.V., Shlyapnikov, S.V., Levdikov, V.M. & Mikhailov, A.M. (1998).
"Serratia marcescens endonuclease refined structure of enzyme at 1.7A resolution and mechanism of its
action". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998.
Abstracts (B), 472-473.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1998). "Very low
resolution ab-initio phasing. Problems and advances". Eighteenth European Crystallographic Meeting,
Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (A), 131-132.
- Lunina, N.L. (1998). "Software for very low resolution ab-initio phasing". Eighteenth European
Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (B), 480-481.
- Petrova, T.E., Lunin, V.Y. & Podjarny, A.D. (1998). "Likelihood base search of the center of a
macromolecular object". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha, Czech Republic,
August 15-20, 1998. Abstracts (B), 481-482.
- Podjarny, A.D., Lunina, N., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Petrova, T. & Lunin, V. (1998).
"Ab-initio phasing at 30 A of the t50S ribosomal particle with the Few Atoms Model method". ACA Annual
Meeting, Arlington, Virginia, July 18-23, 1998, 11.03.08, 74.
- Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Petrova, T., Lunina, N. & Lunin, V. (1998).
"Recent advances on the application of the few atom model method to the T50S ribosomal particle".
Association Francaise de Cristallographie, AFC98, Orleans, 24-27 fevrier 1998, BCG-A02.
- Skovoroda, T.P. & Lunin, V.Y. (1998). "Statistical properties of phase error estimates obtained on
the bas marginal likelihood maximization". Eighteenth European Crystallographic Meeting, Praha,
Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (B), 482.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Y. & Lunina, N.L. (1998). "Seminvariant density decomposition and
connectivity analysis in the low resolution macromolecular phasing". Eighteenth European Crystallographic
Meeting, Praha, Czech Republic, August 15-20, 1998. Abstracts (A), 482-483
- Lunin, V.Yu. (1997). "Likelihood Based Choice of Priors in Statistical Approaches to the Phase Problem".
In Direct Methods for Solving Macromolecular Structures, Lecture Notes, Erice, 22 May-2 June 1997, 457.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1997). "A generalized
likelihood and the phase cluster choice problem". In Direct methods for solving macromolecular
structures, Lecture Notes, Erice, Italy, May 22 - June 02 1997, 485.
- Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1997). "The use of generalized likelihood based
approach in low-resolution ab-initio phasing". Seventeenth European Crystallographic Meeting,
Collected abstracts, Lisboa - Portugal 24/28 August 1997, 53.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Podjarny, A,D. (1997). "Low Resolution Phasing: After First Images".
Workshop "Validation and refinement of macromolecular structures", Abstracts, Porto, Portugal,
August 29-30.
- Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1997). "Statistical Properties of Phase Error Estimates Obtained on the
Base of a Marginal Likelihood Maximization". Workshop "Validation and refinement of macromolecular
structures", Abstracts, Porto, Portugal, August 29-30.
- Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Поджарни А.Д. (1997). "Решение фазовой проблемы при низком разрешении в
кристаллографии белка". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного
излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов,
212.
- Иванов М.Е., Петрова Т.Е., Лунин В.Ю. (1997). "Приближение априорного распределения координат атомов в
кристаллах макромолекул градиентом функции правдоподобия". Национальная конференция по применению
Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна,
25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 218.
- Лунина Н.Л., Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г. (1997). "Выращивание плотности" - новый метод локального улучшения
синтезов Фурье". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного излучений,
Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 222.
- Сковорода Т.П., Лунин В.Ю. (1997). "Надежность показателей достоверности, определяемых на базе принципа
максимума правдоподобия". Национальная конференция по применению Рентгеновского, Синхротронного
излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов, Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов,
225.
- Лунин В.В., Лунин В.Ю., Благова Е.В., Левдиков В.М., Шляпников С.В., Михайлов А.М. (1997).
"Атомная структура молекулы эндонуклеазы Sm 1 при разрешении 1.7 Ǻ". Национальная конференция по
применению Рентгеновского, Синхротронного излучений, Нейтронов и Электронов для исследования материалов,
Дубна, 25-29 мая 1997, Тезисы докладов, 221.
- Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A., Tete-Favier, F., Mitschler, A., Barbanton, J., Barth, P., Urzhumtseva, L.,
Biellmann, J.-F. & Moras, D. (1997). "The crystal structure of the complexes of aldose reductase with
the inhibitors tolrestat and sorbinil". XVIIth European Cryst.Meeting, 24-28 August 1997, Lisbon, Portugal,
14.
- Urzhumtsev, A. & Urzhumtseva, L. (1997). "New interactive tcl/tk-based software for macromolecular
crystallographers". XVIIth European Cryst.Meeting, 24-28 August 1997, Lisbon, Portugal, 184.
- Lunina, N.L. & Urzhumtsev, A. (1997). "Density growing: a new approach to the local improvement of
electron density maps". XVIIth European Cryst.Meeting, 24-28 August 1997, Lisbon, Portugal, 92.
- Lunin, V.Yu. (1996). "Low-resolution ab-initio phasing with Monte-Carlo and clusterization techniques".
XVII Intern.Cryst.Congr., Seattle, USA, August 8-17, 1996, Coll.Abstr., C-63.
- Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D., Mitschler, A., Tete-Favier, F., Barth, P., Biellmann, J.-F. & Moras,
D. (1996). "Etudes cristallographiques des complexes de l’aldose reductase et ses inhibiteurs". Les
Cahiers IMABIO, HS, 4, 82.
- Howard, E.I., Grigera, J.R., Podjarny, A.D. & Urzhumtsev A.G. (1996). "Multicopy modeling of the solvent
distribution in macromolecular crystals". XVII Intern.Cryst.Congr., Seattle, USA, August 8-17, 1996,
Coll.Abstr., C-86
- Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Vernoslova, E.A. (1996). "Very low resolution phasing attempts of the
ribosome 50S particle from T. thermophilus by the Few Atoms Model method". XVII Intern.Cryst.Congr.,
Seattle, USA, August 8-17, 1996, Coll.Abstr., C-67
- Grigera, J.R., Howard, E.I., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1996). "Hydration of biomacromolecules
by multicopy molecular dynamics with diffraction constraints. Bringing into agreement diffraction and
NMR data". Intern.Biophysics Congr. IUPAB, Amsterdam, the Netherlands, 1996, Coll.Abstr.
- Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G., Howard, E.I. & Grigera, J.R. (1996). "Modelisation multicopie de
la distribution du solvant dans les cristaux macromol culaires". AFC96, 10-13 Sept. 1996,
Toulouse, 42.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu., Vernoslova, E.A., Urzhumtseva, L.M. & Podjarny, A.D. (1995). "La methode
FAM pour le phasage ab-initio: Applications". AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, BL15.
- Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Vernoslova, E.A., Lunina, N.L., Petrova, T.E. & Podjarny, A.D. (1995).
"La methode FAM pour le phasage ab-initio: Theorie". AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, P07a.
- Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1995). "R-free based maximum likelihood estimates of phase errors".
4th European Workshop on Crystallography of Biological Macromolecules, Como (Italy),
May 21-25, O43.
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995).
"On the ab-initio solution of the phase problem for macromolecules at very low resolution: the Few Atoms
Models method". 4th European Workshop on Crystallography of Biological Macromolecules,
Como (Italy), May 21-25, O19.
- Podjarny, A.D. & Urzhumtsev, A.G. (1995). "Le remplacement moleculaire a tres basse resolution".
AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, BL08.
- Zagari, A., Sica, F., Vitagliano, L., Scarano, G., Urzhumtsev, A.G., Podjarny, A.D. & Bocchini, V.
(1995). "Cristallisation et analyse preliminaire par rayons X du facteur d’elongation hyperthermophile
EF 1alpha". AFC95, 24-27 Jan. 1995, Grenoble, P43.
- Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1995). "Very low resolution molecular replacement with envelope
models". 4th European Workshop on Crystallography of Biological Macromolecules, Como (Italy),
May 21-25, A04.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu., Vernoslova, E.A., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Navaza, J. & Podjarny, A.D.
(1994). "Very low resolution phasing with simple models". 15th Eur. Cryst. Meeting, Dresden,
Germany, 28.8-2.9/1994, Coll.Abstr., R.Oldenbourg Verlag, Munchen, 217
- Lunin, V.Yu., Lunina, N.L., Petrova, T.E., Vernoslova, E.A., Urzhumtsev, A.G. & "A Monte Carlo Approach
to low resolution phasing in protein crystallography". ACA Annual Meeting, June 25 - July 1, 1994,
INFORUM, Atlanta, Georgia, Atlanta Convention Center, 178
- Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G. & Navaza, J. (1994). "On the solution of the molecular replacement
problem at very low resolution: application to a ribosome model crystal". ACA Annual Meeting,
June 25 - July 1, 1994, INFORUM, Atlanta, Georgia, Atlanta Convention Center, 40.
- Lunin, V.Yu. (1993). "Electron density histograms and the phase problem". Acta Cryst. A49,
S MS-02.01.05.
- Brazhnikov, E., Chirgadze, Yu., Ævarsson, A., Svensson, A. & Lunin, V. (1993). "The Similarity
of results obtained by Solvent Flattening and Low-Resolution Phase retrieval for the Improvement of Protein
Electron Density Map". 3rd European workshop on crystallography of biological macromolecules, Como
(Italy), May 24-8 1993, M4.
- Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1993). "Enveloppes moleculaires modulées en fonction de la
distance au bord". Reunion francophone de cristallographie de macromolécules", Ste Odile
(Strasbourg), 2-5 Juin 1993, P1
- Urzhumtsev, A.G., Podjarny,A.D., Cavarelli, J., Rees, B., Giege, R., Thierry, J.-C. & Moras, D. (1992).
"Low-resolution phasing of the cubic form of the aspartyl tRNA synthetase complex confirmed by molecular
replacement results". Journees Annuelles de l’Association Francaise de Cristallographie; Paris,
5-7 Mai 1992, Ministere de la Recherche et de l’Espace, II-21
- Urzhumtsev, A.G. (1992). "PDB models: errors in stereochemistry". XIVth Eur. Cryst. Meeting,
2-7 August 1992, Enschede, The Netherlands, 234
- Podjarny, A.D., Urzhumtsev, A.G., Cavarelli, J., Rees, B., Giege, R., Thierry, J.-C. & Moras, D. (1992).
"The low-resolution structure of the cubic form of the aspartyl tRNA synthetase complex: comparison of
molecular replacement results and previous ab-initio low-resolution phasing". XIVth
Eur. Cryst. Meeting, 2-7 August 1992, Enschede, The Netherlands, 245
- Urzhumtsev, A.G. & Podjarny, A.D. (1993). "Envelopes moleculaires modulees en fonction de la distance
au bord". Reunion francophone de cristallographie de macromolecules, Ste Odile (Strasbourg), 205 Juin
1993, P1
- Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Skovoroda, T.A. (1990). "Direct low-resolution phasing in protein
crystallography". 16th Int.School on Crystallography, Erice, Italy, 18-29 April, 1990,
Coll.Abstr.
- Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G. & Skovoroda, T.A. (1990). "Direct low-resolution phasing in protein
crystallography". Acta Cryst., A46, S, C-113.
- Urzhumtsev, A.G. (1990). "Molecular bounding by two step filtration of SIR-synthesis". Acta Cryst.,
A46, S, C-114.
- Morgunova, E.Yu., Urzhumtsev, A.G., Mikhailov, A.M. & Vainstein, B.K. (1990). "The CMtV capsid protein
structure at 6A resolution". Acta Cryst., A46, S, C87-88.
- Chirgadze, Yu.N., Vernoslova, E.A., Nikonov, S.V., Sergeev, Yu.V., Brazhnikov, E.V., Fomenkova, N.P., Lunin,
V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1989). "Refined structure of calf lens g-crystallin IIIb at 2.5A resolution".
XIIth European Cryst. Meeting, Moscow, USSR, August 1989, Coll.Abstr., 2, 362.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Vernoslova, E.A. (1989). "FROG - new refinement program". XIIth
European Cryst. Meeting, Moscow, USSR, August 1989, Coll.Abstr., 3, 193.
- Lunin, V.Yu. & Skovoroda, T.P. (1989). "Frequency analysis - new approach to phase improvement in protein
crystallography". XIIth European Crystallographic Meeting, Moscow, 1989, Coll.Abstr., 3, 146.
- Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A., Urzhumtsev, A.G. & Vernoslova, E.A. (1989). "Structure refinement of
"dry" form of calf lens γ-crystallin IIIb at 1.9A resolution". XIIth European Cryst. Meeting, Moscow,
USSR, August 1989, Coll.Abstr., 2, 363.
- Murzin A.G. & Vernoslova E.A. (1988). "Computer modeling of protein hybrids: phage T4 lysozime with a
Ca2+ - binding module (FE-hand)". V conference of young scientist of socialist countries on
Bioorganic Chemistry, Abstracts, Pushchino (USSR), 83-84.
- Urzhumtsev, A.G., Lunin, V.Yu. & Luzyanina, T.B. (1986). "Macromolecular position determination with a
noisy synthesis at low resolution". Xth European Cryst. Meeting, Wroclaw, Poland, Coll.Abstr., 1A-01,
51-52.
- Chirgadze, Yu.N., Nevskaya, N.A., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1984). "Molecular structure of calf
lens protein γ-crystalline at 2.7A resolution". 16-th FEBS Conference, Moscow, 1984, Coll.Abstr.,
232.
- Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1984). "Program construction for refinement of the atomic structure of
macromolecules based on the fast differentiation algorithm". Acta Cryst., A40, S, C-18.
- Lunin, V.Yu., Urzhumtsev, A.G., Chirgadze, Yu.N., Fomenkova, N.P. & Nevskaya, N.A. (1984). " Crystal
structure of the calf lens protein gamma-crystallin III". Acta Cryst., A40, S, C-32.
- Кузин А.П., Уржумцев А.Г. (1983). "Уточнение кристаллической структуры актиноксантина при разрешении 1,8А
МНК в обратном пространстве". VI Всесоюзный симпозиум по химии белков и пептидов, Рига, ноябрь 1983,
Тезисы докладов, 186.
- Вазина А.А., Козлов М.А., Корыстова А.Ф., Крайзман В.Л., Шелестов В.М., Вернослов С.Е., Лунин В.Ю. (1982).
"Методологические аспекты использования EXAFS-спектров для определения структуры белков". I Всесоюзный
Биофизический Конгресс, Москва 1992, Сборник тезисов, III, 215.
- Vazina, A.A., Kozlov, M.A., Korystova, A.F., Kraizman, V.L., Shelestov, V.M., Vernoslov, S.E. &
Lunin V.Yu. (1982). "Methodological aspects of using EXAFS for protein structure determination". The First All-Union Congress on Biophysics, Moscow, 1982, Coll.Abstr., III, 215.
- Фоменкова Н.П., Чиргадзе Ю.Н., Сергеев Ю.В., Невская Н.А., Никонов С.В., Лунин В.Ю., "Структура
g-кристаллинов: функционирование, пространственная гомология доменов, функциональные группы". I
Всесоюзный Биофизический Конгресс, Москва 1992, Сборник тезисов, 17.
- Chirgadze, Yu.N., Sergeev, Yu.V., Fomenkova, N.P., Lunin, V.Yu. & Urzhumtsev, A.G. (1981). "The
structure γ-crystalline IIIb from calf lens". Acta Cryst., A37, S, C-40
- Чиргадзе Ю.Н., Орешин В.Д., Сергеев Ю.В., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Лунин В.Ю. (1980). "Структура
гамма-кристаллинов из глазной линзы теленка при разрешении 5 Ǻ". Симпозиум по химии и физике белков
и пептидов, Сборник тезисов, Баку 1980, 183.
|