14 октября 2024, понедельник
9.00 – 10.00
Регистрация участников (ауд. 320, ИМПБ РАН)
Открытие конференции (конференц-зал, ИМПБ РАН)
10.00 – 10.15 Член-корреспондент РАН Якобовский Михаил Владимирович. Открытие конференции
10.15 – 10.30 Лахно Виктор Дмитриевич. Юбилейная конференция ICMBB24
10.30 – 11.10 Шайтан Константин Вольдемарович. Физические принципы формирования пространственной структуры биополимеров
11.10 – 11.30 Перерыв
Утреннее заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)
11.30 – 12.05 Устинин Михаил Николаевич, Бойко А.И., Рыкунов С.Д. Функциональная томография сложных систем с помощью спектрального анализа данных многоканальных измерений
12.05 – 12.40 Лахно Виктор Дмитриевич. Динамика квантового клеточного автомата на основе квадруплексов ДНК
12.40 – 13.15 Наймарк Олег Борисович. Динамика открытых комплексов и дифференциация фенотипов клеток в условиях микрогравитации
13.15 – 15.00 Перерыв на обед
Секция А Математические основы нанобиоэлектроники (конференц-зал, ИМПБ РАН)
15.00 – 15.25 Фиалко Надежда Сергеевна, Лахно В.Д. Охлаждение полинуклеотида в модели Холстейна
15.25 – 15.50 Коршунова Алевтина Николаевна, Лахно В.Д. Динамика холстейновского полярона под воздействием внешнего постоянного и переменного электрических полей
15.50 – 16.15 Коршунова Алевтина Николаевна, Лахно В.Д. Внутренняя динамика холстейновского полярона в зависимости от начального поляронного состояния
16.15 – 16.40 Фиалко Надежда Сергеевна, Лахно В.Д. Блоховские осцилляции в цепочке с температурой
16.40 – 17.05 Шигаев Алексей С., Лахно В.Д. Исследование равновесной кинетики нуклеации пузырьков денатурации в модели ПБД при физиологических температурах
15 октября 2024, вторник
Утреннее заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)
10.00 – 10.35 Дюк Вячеслав Анатольевич. Сравнение логических методов машинного обучения в задаче прогнозирования характера ремиссии у больных бронхиальной астмой
10.35 – 11.10 Никитюк Александр Сергеевич. Моделирование процесса индентирования клетки с постоянной скоростью на основе статистико-термодинамического подхода
11.10 – 11.45 Богатырев Михаил Юрьевич. Чем инспирированы биоинспирированные алгоритмы
11.45 – 12.15 Перерыв
12.15 – 12.50 Озолинь Ольга Николаевна. Негеномные последовательности в транскриптомах и РНК- секретомах бактерий: алгоритмы поиска и биологическая роль
12.50 – 13.25 Чемерис Алексей Викторович. ДНК – поистине цифровая молекула
13.45 – 15.00 Перерыв на обед
Дневное заседание, секционные доклады
Секция А «Математические модели наноструктур и биомолекул» (конференц-зал, ИМПБ РАН)
15.00 – 15.25 Сааде Масуд. Модели эпидемической задержки развития инфекции
15.25 – 15.50 Лихачев Илья Вячеславович, Балабаев Н.К., Быстров В.С. Влияние замены ионов кальция на ионы железа на плотность гидроксиапатита
15.50 – 16.15 Русаков Алексей Вячеславович, Тихонов Д.А. Вариативность пространственно- временных структур в цепочке связанных логистических осцилляторов
16.15 – 16.30 Перерыв
16.30 – 16.55 Быстров Владимир Сергеевич, Парамонова Е.В., Леденева О.Р., Зеленовский П.С. Моделирование взаимодействия пептидных нанотрубок дифенилаланина с молекулами Methylene blue при поверхностно-усиленной рамановской спектроскопии
16.55 – 17.20 Лихачев Илья Вячеславович, Балабаев Н.К. Анализ плавления ДНК в полноатомной модели
Дневное заседание, секционные доклады
Секция Б «Биоинформатика» (ауд. 306, ИМПБ РАН)
15.00 – 15.25 Тетуев Руслан Курманбиевич, Назипова Н.Н. Быстрое двухбитное кодирование ДНК в системе предсказания специфичности гибридизации олигонуклеотидов с мишенями TANDIS
15.25 – 15.50 Чалей Мария Борисовна, Кутыркин В.А. Оптимизация распознавания подрода коронавирусов на основе N-генов прототипных штаммов
15.50 – 16.15 Петрова Татьяна Евгеньевна, Джус У.Ф., Зюркалова Д. В., Глухов А.С., Курочкина Л.П., Габдулхаков А.Г. Использование моделей, предсказанных нейросетью AlphaFold, для определения структуры шаперонина бактериофага OBP
16.15 – 16.30 Перерыв
16.30 – 16.55 Панкратова Наталья Михайловна, Панкратов А.Н. Определение изменений метаболизма в плазме крыс с саркомой М1 в данных 1H-ЯМР-спектроскопии
16.55 – 17.20 Руднев Владимир Ремович, Никольский К.С., Куликова Л.И., Петровский Д.В., Кайшева А.Л. SH3-домен, 3α-пучок и 3β-уголок: автономно стабильные структурные мотивы
17.20 – 17.40 Перерыв
17.40 – 18.05 Петровский Денис Витальевич, Никольский К.С., Куликова Л.И., Руднев В.Р., Кайшева А.Л. Модель BERT в секвенировании белков de novo с использованием тандемных масс- спектров
18.05 – 18.30 Панкратов Антон Николаевич, Панкратова Н.М. Распознавание повторов в белках на основе спектрального подхода и методов конструктивной аппроксимации
Постерная сессия (стендовые доклады)(холл 3-го этажа, ИМПБ РАН)
Быков Георгий Александрович, Пантелеев М.А. Глобальные и локальные изменения гемодинамики при венепункции
Божко Анастасия Алексеевна, Пантелеев М.А. Математическая модель мембранно-зависимой активации фактора свёртывания Х
Фурлетова Евгения Игоревна. Оптимизация алгоритма SufPref вычисления P-значения вхождений образцов. Минимизация графа перекрытий
Иванова Полина Романовна, Вервейко Д.В., Браже А.Р., Верисокин А.Ю. Влияние нейротрансмиттеров на нейрональную активность в модели нейроглиоваскулярной единицы
Бойко Анна Ивановна, Устинин М.Н., Рыкунов С.Д. Открытые репозитории данных энцефалографии
Заочные доклады
Mondal S., Sengupta S., Lahiri Ansuman On the Prediction of Folding and Stability of Quadruplexes
Назипова Нафиса Наиловна, Теплухина Е.И. Полногеномная технология обнаружения размытых мегасателлитов и протяженных разнесенных повторов
Сидорова Алла Эдуардовна, Левашова Н.Т. Применение теории активных сред для моделирования развития урбоэкосистем
Луценко А.О., Сидорова А.Э. Метод оценки хиральности надвторичных белковых структур
Шпигун Д.К., Сидорова А.Э., Левашов П.А. Связь хиральности спиральных структур с физическими характеристиками лизоцимов
Москаленко Андрей Витальевич, Махортых С.А. Бифуркационное пятно в двумерной версии модели Алиева–Панфилова
Мирошниченко Любовь Александровна, Гусев В.Д. Профили сложности геномов сальмонелл Презентация доклада
Слузова Наталья Александровна. Методика расчета экономического коэффициента в популяционной модели роста биомассы водорослей
Воропаева Ольга Фалалеевна. Иерархический подход в математическом моделировании динамики иммунной и болевой реакции на асептическое повреждение
Васильева Ирина Ивановна, Дружинина О.В., Масина О.Н.Построение и численный анализ популяционных динамических моделей с учетом конкуренции и миграции видов
Боженко В.К., Кулинич Татьяна Михайловна, Кудинова Е.А., Иванов А.В., Шишкин А.М., Солодкий В.А. Оптимизация пептидной последовательности с применением методов анализа энергии взаимодействия для получения перспективных противоопухолевых препаратов
Панюков Валерий Васильевич, Озолинь О.Н., Киселев С.С. Вариации нуклеотидного состава и отклонения от второго правила Чаргаффа в бактериальных хромосомах
Романов Михаил Сергеевич, Мастеров В.Б. Щадящий метод оценки дистанции вспугивания птиц с использованием цензурированных данных
Иванова Наталья Владимировна, Шашков М.П., Созонтов А.Н., Филиппова Н.В., Ермолов С.А., Соколова С.С., Устинова А.Л., Плакхина Е.В. Опыт реализации региональных проектов оцифровки литературного наследия
Шашков М.П., Иванова Наталья Владимировна, Ермолов С.А. Применимость наборов данных растровых слоев с факторами среды в качестве предикторов для моделирования ареалов дождевых червей
Дюкова Анастасия Петровна, Дюкова Е.В. О методах машинного обучения в задаче предсказания промоторов Презентация доклада
16 октября 2024, среда
Утреннее заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)
10.00 – 10.30 Кулеш Виктория Сергеевна, Песков К.В., Бочаров Г.А. Математическое исследование возрастных изменений гомеостаза Т-лимфоцитов человека
10.30 – 11.00 Никитич Антонина Алексеевна, Песков К.В., Бочаров Г.А. Исследование иммунного ответа при инфекции вирусом LCMV с помощью математического моделирования
11.00 – 11.30 Угольков Ярослав Александрович, Волкова А.А., Песков К.В., Соколов В.В. Системно-фармакологическая модель В-клеточного иммунитета в системной красной волчанке
11.30 – 12.00 Перерыв
12.00 – 12.30 Киреев Борис Владимирович, Никитич А.А., Соколов В.В., Песков К.В., Волкова А.А. Разработка системной фармакологической модели иммунных процессов заболевания дерматомиозит для поиска новых мишеней и разработки препаратов
12.30 – 13.00 Даничкина Ксения Викторовна, Жуденков К.В. Сравнительный анализ методов извлечения данных об индивидуальной выживаемости
13.00 – 13.30 Рыкунов Станислав Дмитриевич, Бойко А. И., Устинин М.Н. Реконструкция электрической структуры тела человека методом спектральной функциональной томографии
13.30 – 15.00 Перерыв на обед
Дневное заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)
15.00 – 15.30 Быстров Владимир Сергеевич, Парамонова Е.В., Филиппов С.В., Лихачев И.В., Быстрова А.В., Авакян Л.А., Ковригина С.А., Макарова С.В., Булина Н.В. Особенности структуры и свойств гидроксиапатита с различными катионными замещениями
15.30 – 16.00 Левченко Ирина Николаевна, Панкратов В.С., Владимиров Г.К., Левченко А.А., Володяев И.В. Исследование структуры кардиолипина, ацильной цепи в составе гетерогенного катализатора в присутствии кумарина C314
16.00 – 16.30 Михайлова Анна Алексеевна, Песков К.В., Соколов В.В. Применение Байесовского подхода для оценки параметров механистических моделей количественной фармакологии
16.30 – 17.00 Мишина Анна Евгеньевна, Жуденков К.В., Песков К.В. Эффективность детерминистических моделей в прогнозировании ответа опухоли и приобретенной резистентности у пациентов с НМРЛ
17.00 – 17.30 Тарновский Денис Александрович. Вариант математического моделирования физиологических процессов
17 октября 2024, четверг
Утреннее заседание, пленарные доклады (конференц-зал, ИМПБ РАН)
10.00 – 10.35 Соколов Александр Витальевич, Болондинский В.К., Молчанов А.Г. Оценка области применения математических моделей: Моделирование транспирации и фотосинтеза сосны обыкновенной в различных климатических условиях
10.35 – 11.10 Лелеков Александр Сергеевич. Кинетические и продукционные характеристики культуры микроводорослей в условиях светолимитирования
11.10 – 11.25 Перерыв
Дневное заседание, секционные доклады
Секция А «Вычислительная экология» (конференц-зал, ИМПБ РАН)
11.25 – 11.50 Портнов Алексей Михайлович, Иванова Н.В., Шашков М.П., Шанин В.Н. Различия в результатах детекции деревьев разных видов в пологе разновозрастного полидоминантного широколиственного древостоя с помощью нейросети YOLO
11.50 – 12.15 Минаев Игнат Сергеевич, Нуриева Н.И., Тютюнов Ю.В., Медвинский А.Б. Численная оценка влияния абиотических факторов на характеристики динамики таксономических групп фитопланктона Нарочанских озер
12.15 – 12.40 Минаев Николай Сергеевич, Нуриева Н.И., Тютюнов Ю.В., Тихонов Д., Адамович Б., Медвинский А.Б. Трофические взаимодействия фитопланктон-зоопланктон в экосистеме Нарочанских озер
12.40 – 13.20 Ханина Лариса Геннадьевна, Бобровский М.В., Смирнов В.Э., Романов М.С., Волобуев С.В., Шелякин П.В., Бессонова Т.А., Тутукина М.Н. Разложение валежа и сукцессия сообществ грибов и бактерий в широколиственных лесах
13.20 – 13.40 Перерыв
13.40 – 14.00 Закрытие конференции
